正式には「浄土真宗本願寺派本願寺築地別院」と言い、関東の人々に「築地本願寺さん」と親しまれています。
築地本願寺の発祥は、元和3(1617)年、西本願寺の別院として、第十二代宗主(ご門主)准如上人によって建立されました。
当時、浅草近くの横山町にあったことから「江戸浅草御坊」と呼ばれていましたが、明暦3(1657)年、歴史的に有名な振袖火事で焼失してしまいました。しかし大火後の幕府の区画整理のため、旧地への再建が許されず、その替え地として下付されたのが八丁堀の海上でした。
そこで佃島の門徒が中心になり、本堂再建のために海を埋め立てて土地を築き、延宝7(1679)年に再建。「築地御坊」と呼ばれるようになりました。
その後、関東大震災で崩壊した本堂の再建では、東京(帝国)大学工学部教授・伊東忠太博士の設計による古代インド様式で昭和6(1931)年に起工、3年後の昭和9(1934)年に落成され現在に至っています。
この建物は、インド洋式の石造りとなっていますが、本堂内は従来通りの桃山様式を取り入れた荘厳となっています。